Pipeline Pilot 介绍
Pipeline Pilot 是一个图形化的科学应用软件,它能够优化研究创新过程,提高运营效率,降低研究和 IT 成本。BIOVIA Pipeline Pilot
能够自动化分析数据,使企业的所有用户都能够快速搜索,可视化和报告研究结果。
Pipeline Pilot 软件特点
强大的数据处理能力
灵活的数据与应用程序整合能力
最佳流程的共享和部署能力
可定制的报告和网络应用的开发能力
灵活的系统架构和客户端类型
拓展BIOVIA其他应用程序的能力
Pipeline Pilot 价值
利用现有的研究和知识产权以及自动化数据收集和过程分析,大大加快项目进度(10 倍或更多)
在单个环境中快速聚合和处理来自多个不同研究领域的大量结构化和非结构化数据,发现隐藏在数据中的知识
实施最佳的解决方案,确保合规性和实现不同组织见的协同合作
开发科学的仿真计算模型,降低实验研究成本
基于标准化技术和广泛接受的科学知识,快速构建和部署高质量的科学解决方案
实时报告可以帮助科研人员改进实验决策,更快地得到理想的实验结果
下图展示Pipline Pilot模块信息:
CHEMISTRY化学
Chemistry
通过化学智能过滤器和学习功能,可以分析,管理公司数据库中的化学物质。该集合还包括化学试剂盒-高性能数据试剂盒,使您能够在Oracle中存储和搜索化学结构和反应。
ADMET
分子集合(例如合成候选物,供应商库和筛选集合)的预测吸收,分布,代谢,排泄和毒性(ADMET)属性。该集合包括人体肠道吸收,水溶性,血脑屏障渗透,血浆蛋白结合,细胞色素P450 2D6抑制和肝毒性的模型。
生物
基因表达和质谱分析
基因表达致力于可视化,分析,注释和报告包括单个靶基因在内的基因表达实验。核心功能基于BioConductor,这是用于分析和理解基因组数据的开源软件。质谱提供了一套全面的组件和示例协议,可创建和自动化定制的蛋白质组学和代谢组学工作流程。
基因序列分析
在可以将模块化工具图形化链接在一起以创建实用的生物信息学例程的环境中,分析,注释和比较生物序列。
高通量测序(NGS)
分析和解释由最新的DNA测序仪器生成的大量数据集。NGS Collection附带了各种各样的NGS数据分析管道,它们准备以无与伦比的功能和灵活性来分析您的数据。
数据库&应用集成
集成
Integration是基础Pipeline Pilot系统的一部分,可让您使用Java,Python,REST将现有的内部程序或第三方程序作为计算服务纳入其中。另外,使用ODBC和JDBC技术从Oracle检索数据进行分析或报告,并将结果直接存储回自己的公司数据库中。
图像
图像处理
成像提供增强,处理,分析,集成,分类,搜索和报告图像数据的功能。它在统一的计算框架中将图像数据与数字,化学,图形和文本数据集成在一起。
分析&统计
分析和机器学习
借助这套全面的学习和数据建模工具,针对大型现实数据集进行了优化的统计过滤器和集群组件,可以进行强大的分析和机器学习。访问强大的方法,例如快速数据聚类,贝叶斯学习,主成分分析,线性回归和偏最小二乘回归。集合中提供了用于递归分区(RP),多目标Pareto优化和多种RP方法的高级建模方法,包括单树和树型学习者林。此外,组件可用于统计方法,以进行数据处理,聚类,学习,经典和探索性数据分析。基础的统计引擎是广泛使用的公共领域R统计软件包。
材料建模&仿真
Materials Studio
通过Material Studio集合,您可以在Pipeline Pilot数据管道环境中访问Materials Studio的主要建模功能。它允许访问分析功能,例如Reflex和Reflex QPA,QSAR Plus软件包的关键功能以及用于将在Material Studio脚本API中开发的脚本应用程序集成到Pipeline Pilot协议中的实用程序。
聚合物参数(Synthia)
聚合物参数预测程序提供了一种基于重复单元信息,分子量和温度快速估算本体,非晶态均聚物和无规共聚物特性的方法。
报告&可视化
报告
作为基础PipelinePilot系统的一部分,Reporting提供了一组全面的组件来创建自定义报告,您可以使用这些报告来显示数据分析和挖掘协议的结果。通过完全控制要包含的内容以及布局的方式,您可以创建高效的交流工具,与同事共享知识。
Dashboards
使用Pipeline Pilot内置的HTML5图表功能,可以轻松地为任何设备构建现代化的响应式仪表板。
实验室
实验室数据分析
访问读取,写入,报告,可视化,操纵和执行板数据计算的方法。该集合允许您在数据管道上收集每个数据记录,并可以从不同维度分析您的数据。该集合还支持访问您在分析实验室中生成的数据,例如,常用数据处理操作,例如峰识别,峰积分,线宽分析背景检测和去除,内插,截断,谱图缩放和平滑,谱图减法,傅里叶变换以及NMR特定功能。
文档搜索&分析
文档&文本
通过文档和在线资源搜索,表征和分析,可以使用新信息来增强处理例程,并且用户可以对公共文档和内部文档进行化学智能的文本挖掘。编辑现有文档的高级功能可实现手动文档编辑与自动分析以及内容插入之间的高效集成。
Clarivate Analytics
借助Clarivate Analytics Cortellis™集合,您可以通过直接从Pipeline Pilot Protocols的Cortellis数据库访问广泛的生命科学信息,并将其与您的内部数据相互集成,从而简化与“数据泛滥”保持一致的过程。Cortellis系列是BIOVIA与Clarivate Analytics之间持续合作关系的一部分,可访问Cortellis数据库,包括药物靶标,化合物,公司,临床试验和结果以及专利等。
下图展示Pipline Pilot价值概览: