Discovery Studio 介绍

Discovery Studio 是面向生命科学领域的新一代分子建模和模拟环境。它服务于生命科学领域的实验生物学家、药物化学家、结构生物学家、计算生物学家和计算化学家，应用于蛋白质结构功能研究，以及药物发现。为科学家提供易用的蛋白质模拟、优化和药物设计工具。通过高质量的图形、多年验证的技术以及集成的环境，DS将实验数据的保存、管理与专业水准的建模、模拟工具集成在一起，为研究队伍的合作与信息共享提供平台。

业界挑战与解决方案

药物发现是一项复杂的多目标优化工作。科学家必须在优化生化效能的同时，优化 ADME 和毒性等其他特性。Discovery Studio 软件基于领先的科研信息处理平台 Pipeline Pilot，集成众多业已详实验证的业界标准算法（如 CHARMm、 MODELER 、 ZDock 、 Delphi 、 Catalyst、 DMol3 、 Vamp 、 TopKat、 AggMap 和 Developability Index），是目前用于生命科学药物发现研究的先进产品组合。

Discovery Studio 产品优势

• 灵活方便的使用方式

• 准确可信的科学算法 

• 全面综合的研究协同 

• 广泛丰富的应用领域

• 卓越强大的可拓展性
  

Discovery Studio 产品特点

分子模拟：

基于 CHARMm 力场引擎的一流分子模拟工具， 能够处理单点能量计算、结构优化、分子动力学模拟和 自由能计算

提 供 完 整 强 大 的 量 子 力 学 工 具 包 ， 包 括 密 度 泛 函 （DMol³）、半经验（VAMP）和量子力学/分子力学 QM/MM（DMol³/CHARMm）仿真功能

大分子设计与分析：

市场领先的 MODELER 同源建模算法

业界先进的基于 pH 的蛋白质离子化工具

独特的基于 pH 的蛋白质稳定性和结合亲和力突变分析功能

使用 ZDOCK 提供可靠的蛋白质结合预测

抗体设计

抗体研究专用的结构预测与仿真完整工具集

成熟自动化结构预测工作流，旨在交付业界最佳的抗体 同源模型

独特的专利技术 AggMap 蛋白质空间聚集和 DI （Developability Index）算法

快速识别生物疗法中转译后修饰（PTM）位点相关序列

基于结构的药物设计（Structure-based design，SBD）

全新物理对接引擎（CHARMm CDOCKER）

独特的非键力分析工具，直观标识有利、不利和不满意的相互作用类型

基于 MMP 的 Activity Cliffs

基于片段的药物设计（Fragment-based design, FBD）

使用经典的 Medicinal Chemistry 反应确保实时性，可使用 BIOVIA ACD 提供的上万种预过滤试剂

使用 BIOVIA SCD 提供的约 150 万种商用化合物就地开 展骨架迁越

新颖的 Karplus MCSS（多复本并行搜索）片段对接引擎

基于药效团的药物设计

市场领先的 CATALYST 药效团引擎

基于受体结构产生精准的药效团模型

市面最大的受体-配体复合物药效团数据库 PharmaDB

基于小分子的药物设计和毒理学

QSAR：计算物理化学、拓扑学指纹属性，并可使用 PLS、 GFA、MLR 等多种统计工具进行建模和数据挖掘

最丰富的 ADMET 和预测性毒理学模型，能够预测包括 BBB 渗透性、肝毒性、CYP2D6、AMES、大鼠口服 LD50 等毒理性质

生物大分子 X-ray 晶体结构解析

使用 CNX 生成电子密度图，开展优化；使用 HT-X PIPE 运行蛋白质-配合基复合体的自动结构判定

下图展示Discovery Studio模型图片：